Це зумовлено різноманітністю літологічного складу та водно-фізичних властивостей гірських порід, умов їх залягання, історією геологічного розвитку території та особливостями сучасних фізико-географічних умов у різних частинах республіки.
Поверхневі води Ханти-Мансійського автономного округу дуже низькою мінералізацією (зниженим вмістом кальцію та магнію), значно підвищеним вмістом заліза та марганцю та високим ступенем забрудненості нафтою та ртуттю.
Територія автономного округу знаходиться у зоні тайги. Рельєф регіону різноманітний: є рівнини, передгір'я та гори. Найвищі точки – гора Народна (1895 м) на Приполярному Уралі та гора Педи (1010 м) на Північному Уралі. Третину території округу займають болота.
Флора на території Югри досить багата, адже налічується понад вісімсот видів цінних рослин. Місцева рослинність є хвойні та змішані ліси, заливні луки, болота, гірські тундри та водоймища. На території середньої тайги ростуть сибірський кедр, сосна, ялина, ялиця, вільха, береза та модрина.
Республіка Башкортостан володіє багатими запасами поверхневими та підземними водними ресурсами. У межах території протікає 12725 рік загальною протяжністю 57366 км. Основну частину їх (92%) становлять малі річки довжиною менше 10 км, річний стік – до 70%.
Башкортостан відноситься до помірної кліматичної зони з атлантико-континентальним кліматом. Клімат достатньо вологий, зима помірковано сувора, літо тепле.
На стан поверхневих вод надає сильний вплив антропогенний фактор, пов'язаний з діяльністю найбільшого на території Росії нафтовидобувного комплексу та активним розвитком, забудовою міст. Близько 65% стоків, що скидаються у водні об'єкти округу, забруднені або не пройшли достатню очистку.
У місті Ханти–Мансійська вода абсолютно нешкідлива.