Сергій Ніконенко народився 16 квітня 1941 року у сім'ї робочих. Здобув дві освіти: у 1964 році закінчив акторську майстерню, а у 1972 – режисерську майстерню Сергія Герасимова та Тамари Макарової у ВДІКу. Першою помітною роботою актора стала роль Юрія Павлова у фільмі Сергія Герасимова «Люди та звірі» (1962).

До 1974 року Сергій Никоненко служив у Театрі-студії кіноактора. У 2000-х роках грав в антрепризних спектаклях: «Чапаєв і Пустота» за мотивами роману Віктора Пєлєвіна, «Все проходить» за п'єсою Олега Данилова, «Скляний пил» за комедії Ганни Слуцької, «Безіменная зірка» за твором Михайла Себастьяна.

Сергій Ніконенко – Офіційний сайт театру «Російська пісня»

Потім фільмографія артиста поповнилася ролями в таких відомих фільмах, як «Незакінчена п'єса для механічного піаніно», «Червона площа», «Дивні люди», «Пий пісню, поет», «Трин-трава», «Хвилі Чорного моря», «Фантазії Веснухіна», «Теміни», «Тімі», «Тіма» «Анкор, ще анкор!», «Класик», «Китайський сервіз».

Театра Вахтангова Одна з найбільш затребуваних актрис Росії, кумир мільйонів телеглядачів, Вахтангівка «на народження», актриса фантастичної чарівності та таланту, Нонна Гришаєва на сцені Театру Вахтангова грає у спектаклях «Мадемуазель Нітуш», «Солом'яний капелюшок» та «Люся. Освідчення в коханні».

Театрі Ленком Олександра Захарова у Театрі Ленком

Розпочав кар'єру у професійному хокеї 1985 року у складі мінського «Динамо» у Першій лізі радянського хокею. Через рік став гравцем московського ЦСКА. У 1986 – 1990 роки грав у ЦСКА. Із самого початку Сергій виявляв видатну здатність до гри у різних стилях та на різних позиціях.

Серед його ролей: Граф Орлов (Царське Полювання), Фредді Пейдж (Глибоке синє море), Денні (Найправдивіша легенда одного кварталу), Астров (Дядя Ваня), Густав (Вітер шумить у тополі), Гусар у відставці (Євгеній Онєгін), Гвідо (1)